Mặc dù có thể chà đạp lên thực vật và động vật trên mặt đất làm tổ (như rùa biển), và không được coi là loài bản địa với các đảo này, nhưng chúng được phép ở lại vì ý nghĩa lịch sử. Chúng sống bằng chăn thả trên đầm lầy cỏ, trong đó cung cấp cho chúng nước cũng như thức ăn, bổ sung bởi hồ nước ngọt tạm thời. Để tránh quá tải dân số và giao phối cận huyết, và để bảo vệ môi trường sống do bị chăn thả quá mức, những con ngựa được quản lý bởi các dịch vụ quốc gia bang Bắc Carolina, và một số tổ chức tư nhân. Những con ngựa được giám sát đối với các bệnh như thiếu máu truyền nhiễm ngựa, một ổ dịch được phát hiện và sau đó loại bỏ vào năm 1996. Chúng được giữ gìn tránh giao thông trên các quần đảo Bắc Carolina Quốc lộ 12. được giới hạn bởi việc nuôi con nuôi và kiểm soát sinh đẻ.

Khi chúng được xem như là một phần của di sản ven biển Bắc Carolina, chúng đã được phép ở lại trên đảo. Để đối phó với dân số đang tăng, tránh giao phối cận huyết và cố gắng để giảm thiểu thiệt hại về môi trường, một số tổ chức đối tác trong việc quản lý đàn gia súc. Từ năm 1959, ngựa trên đảo Ocracoke đã bị giam giữ trong các khu vực có rào chắn của khoảng 180 mẫu Anh (0,73 km2; 0,28 dặm vuông). Các khu vực bảo vệ những con ngựa từ giao thông của Bắc Carolina Quốc lộ 12, cũng như bảo vệ các hòn đảo từ chăn thả quá mức. NPS, cơ quan quản lý đàn gia súc Ocracoke, bổ sung chế độ ăn uống của con ngựa có hay bổ sung và có ngũ cốc. Năm 2006, để đề phòng bị cận huyết, hai nhóm từ đàn Shackleford được vận chuyển đến đảo Ocracoke.

Luật công 105-229, thường được gọi là Đạo luật Shackleford phán rằng các con ngựa trên đảo Shackleford là phải được cùng được quản lý bởi các công viên quốc gia và một pháp nhân phi lợi nhuận có trình độ (hiện là nền tảng cho Ngựa Shackleford). Đàn ngựa này phải được giới hạn tầm khoảng 120-130 con ngựa. Quản lý dân cư phải đạt cho được thông qua việc áp dụng và bằng cách dùng thuốc ngừa thai ở lợn zona pellucida (PZP) để tiêm vào con ngựa cái thông qua súng phóng phi tiêu (phóng lén vào mông chúng).

Dân số ngựa của hòn đảo này đã được giám sát một cách chặt chẽ bởi số hiệu quản lý đóng dấu lên mông trái của mỗi loài vật ở nơi đây để quản lý. Việc xác định một cách chính xác các cá thể cho phép các công viên quốc gia để đảm bảo tỷ lệ về giới tính phù hợp và chọn được những con ngựa cái để tiêm với PZP. Công tác di dời đã được chính quyền Mỹ triển khai khẩn trương. Từ năm 2000, con nuôi từ Shackleford đã được quản lý bởi Quỹ Ngựa Shackleford. Tính đến năm 2007, đã có 56 con ngựa đã tìm thấy ngôi nhà mới của mình, 10 con cư trú chung số hòa bình với một đàn bò trên đảo Cedar, và hai con đã được chuyển đến các đàn ở đảo Ocracoke.

Ngày 12 tháng 11 năm 1996, những con ngựa Shackleford được làm tròn lên do Sở Thú Bắc Carolina Division Nông nghiệp và thử nghiệm cho bệnh thiếu máu truyền nhiễm ngựa (EIA). EIA là một căn bệnh có khả năng gây chết người, một lentivirus truyền qua chất dịch cơ thể và côn trùng. Bảy mươi sáu trong số 184 con ngựa bị bắt quả tang có kết quả dương tính. Những người xét nghiệm âm tính được phép ở lại trên đảo và những con có bệnh đã được vận chuyển đến các cơ sở kiểm dịch tạm thời. Tìm một khu vực bị cô lập vĩnh viễn cho một số lượng lớn các con ngựa là một nhiệm vụ đầy thách thức cho các tổ chức này; tám ngày sau, nhà nước tuyên bố tất cả các vị trí đề xuất cho cả đàn không phù hợp. Ra lệnh 76 con ngựa bị nhiễm bệnh. Hai con ngựa nữa bị chết trong quá trình-một trong đó đã từng bị thương trong quá trình roundup, và một con non không bị nhiễm bệnh mà lọt vào bầy cách ly được với mẹ của mình.

Như một hệ quả của sự phát triển Corolla vào những năm 1980, những con ngựa trên đảo Currituck đã tiếp xúc với con người thường xuyên hơn và cũng xảy ra nhiều vụ đụng xe với con người. Năm 1989, mười một con đã bị giết chết bởi một chiếu xe trên mới được xây dựng Quốc lộ 12. Cũng trong năm đó, Quỹ Horse Corolla Wild, một tổ chức phi lợi nhuận, được lập ra để bảo vệ những con ngựa từ sự can thiệp của con người. Như một kết quả của những nỗ lực của mình, phần còn lại của đàn đã được chuyển đến một vùng xa xôi hơn của hòn đảo, nơi họ đã rào vào khoảng 1.800 mẫu Anh (7,28 km2; 2,81 sq mi) từ quỹ đất liên bang và của tư nhân kết hợp tặng cho.

Ủy viên Corolla tuyên bố các nơi bất khả xâm xạm của con ngựa. Mâu thuẫn trong việc bảo tồn những con ngựa tiếp tục vào năm 2012. Trong năm 2013, pháp luật là giới thiệu để giúp bảo vệ đàn gia súc trên Carrituck. Không có hành động quản lý nào đã được thực hiện cho đến cuối những năm 1980 và đầu những năm 1990, khi sau nhiều năm hưng thịnh về dân số, năng lực thực hiện của hòn đảo này đã vượt quá tải chịu đựng. Nạn suy dinh dưỡng diễn ra bởi tình trạng quá tải dẫn đến cái chết của một số con ngựa vì còi cọc và đói ăn nhân viên của khu bảo tồn lập một chương trình kiểm soát sinh để điều chỉnh các đàn với khoảng 40 loài động vật.